Parabacteroides
| Domaine | Bacteria |
|---|---|
| Embranchement | Bacteroidota |
| Classe | Bacteroidia |
| Ordre | Bacteroidales |
| Famille | Tannerellaceae |
Espèces de rang inférieur
Parabacteroides est un genre de bactérie à Gram négatif auparavant inclus dans le groupe de bactéries du genre Bacteroides résistantes à la bile. Parabacteroides fait partie de l'ordre des Bacteroidales et du phylum Bacteroidota.
Historique
[modifier | modifier le code]Dans le genre Bacteroides plusieurs espèces dont Bacteroides distasonis faisaient partie d'un groupe de bactéries dites «groupe Bacteroides fragilis» résistantes à la bile. Cette espèce, décrite en [2] a été reclassée comme Parabacteroides distasonis à la suite de l'analyse de sa séquence de l'ARNr 16S et a donné naissance au genre Parabacteroides[1].
Taxonomie
[modifier | modifier le code]Étymologie
[modifier | modifier le code]L'étymologie du genre Parabacteroides est la suivante : Gr. pref. para-, à côté de; N.L. masc. n. Bacteroides, un nom de genre bactérien; N.L. masc. n. Parabacteroides, qui ressemble aux Bacteroides[3],[4].
Classification Phylogénique
[modifier | modifier le code]Des bactéries du groupe résistant à la bile identifiées comme des Bacteroides ont présenté une meilleure similarité de séquence de l'ARNr 16S avec l'espèce Tannerella forsythensis (près de 90%) contre seulement 82% (environ) avec les autres espèces de Bacteroides et environ 84% avec un groupe de Porphyromonas[1]. L'analyse phylogénique qui en a été déduite a positionné les trois bactéries de ce groupe (Bacteroides distasonis, B. goldsteinii et B. merdae ) dans un même clade plus proche des genres Tannerella et Porphyromonas que de Bacteroides[5]. Ce genre a d'abord été classé dans la famille Bacteroidaceae[6] puis à partir de proposé pour être dans celle des Porphyromonadaceae[7]. En , Parabacteroides est reclassé dans la famille des Tannerellaceae, l'ordre des Bacteroidales[8], la classe des Bacteroidia et dans le phylum Bacteroidota[4].
Liste des espèces
[modifier | modifier le code]Selon la LPSN (21 février 2023)[9], le genre Parabacteroides comprend 11 espèces publiées de manière valide.
- Parabacteroides acidifaciens Wang et al. 2019
- Parabacteroides chartae Tan et al. 2012
- Parabacteroides chinchillae Kitahara et al. 2013
- Parabacteroides chongii Kim et al. 2019
- Parabacteroides distasonis (Eggerth and Gagnon 1933) Sakamoto and Benno 2006
- Parabacteroides faecis Sakamoto et al. 2015
- Parabacteroides goldsteinii (Song et al. 2006) Sakamoto and Benno 2006
- Parabacteroides gordonii Sakamoto et al. 2009
- Parabacteroides hominis Liu et al. 2022
- Parabacteroides johnsonii Sakamoto et al. 2007
- Parabacteroides merdae (Johnson et al. 1986) Sakamoto and Benno 2006
Description
[modifier | modifier le code]Les bactéries du genre Parabacteroides sont des bacilles à Gram négatif non mobiles anaérobies strictes[6],[3]. Ces bactéries ne forment pas de spores. Ce genre comprend des bactéries catalase positives et est négative pour les tests uréase et de liquéfaction de la gélatine[3].
Habitat
[modifier | modifier le code]Les bactéries du genre Parabacteroides sont fréquemment isolées dans les fèces humaines où l'espèce Parabactéeroides distasonis est l'une des plus communément identifiées [3]. Des souches de ce genre bactérien peuvent être identifiées dans des échantillons cliniques[3].
Pathogénicité
[modifier | modifier le code]Des travaux récents identifient des bactéries intestinales du genre Parabacteroides, en particulier Parabacteroides goldsteinii, comme l'un des acteurs principaux, voire l'acteur central du déclin cognitif lié à l’âge[10].
L'abondance de cette bactérie augmente chez l'Humain lors du vieillissement (et elle se transmet en outre aisément entre individus). L'hypothèse explicative retenue en 2026 est qu'elle produit des acides gras à chaîne moyenne capables (de 6 à 12 carbones dont par ex. caproïque C6, caprylique C8, caprique C10, laurique C12). Ces composés sont facilement et rapidement utilisés comme source d’énergie, car ils passent directement dans la veine porte sans nécessiter de transporteurs complexes), mais ils peuvent aussi induire une inflammation des cellules périphériques issues de la lignée myéloïdes (pour rappel, les cellules myéloïdes sont un groupe de cellules du système immunitaire qui rassemble les Monocytes, macrophages, cellules dendritiques et certains granulocytes ; spécialisées dans la détection de certains signaux de danger, qui sous l'effet de ces signaux produisent une inflammation. Ces cellules coordonnent la réponse immunitaire périphériques via le récepteur GPR84. Cette activation inflammatoire perturbe le fonctionnement des neurones afférents du nerf vague, affaiblit la transmission interoceptive entre l’intestin et le cerveau, ce qui inhibe l'activation hippocampique nécessaire à l’encodage mnésique[10].
Chez la souris de laboratoire, une colonisation expérimentale de l'intestin d'individus jeunes, par P. goldsteini, suffit à altérer leur mémoire, tandis que des interventions ciblées — notamment avec des bactériophages dirigés contre des espèces proches, ou l’inhibition du récepteur GPR84, ou la restauration de l’activité vagale — permettent d’atténuer les effets cognitifs délétères associés à cette expansion bactérienne. le fait que les acides gras à chaîne moyenne altèrent la mémoire en activant le récepteur GPR84, est aussi « confirmé par la résistance des souris dépourvues de ce récepteur et par l’effet protecteur de son inhibition » (par des antibiotiques[10].
L’ensemble de ces résultats désigne ainsi P. goldsteinii comme un déterminant clé des altérations du microbiote intestinal contribuant au vieillissement cérébral[10]. Si un même mécanisme est confirmé chez l'Humain (ce qui est probable), cette découverte laisse espérer que des thérapies ciblant l’intestin puissent dans le futur freiner ou inverser le déclin de la mémoire très fréquent chez la personne âgée. C’est une preuve de plus de l'importance du microbiome pour le fonctionnement et le vieillissement cérébral » a commenté le neuroscientifique irlandais John Cryan selon qui « peut-être pouvons-nous cibler cela par l’alimentation ».
Notes et références
[modifier | modifier le code]- Sakamoto et Benno 2006, p. 1599.
- ↑ Eggerth et Gagnon 1933.
- Sakamoto et Benno 2006, p. 1602.
- (en) « Genus Parabacteroides », sur LPSN,
- ↑ Sakamoto et Benno 2006, p. 1601.
- Krieg 2010, p. 33.
- ↑ Krieg 2010, p. 61.
- ↑ Ormerod et et al. 2016, p. 36.
- ↑ List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), consulté le 21 février 2023.
- (en) Timothy O. Cox, Ashwarya S. Devason, Alan de Araujo et Sydney Mason, « Intestinal interoceptive dysfunction drives age-associated cognitive decline », Nature, (ISSN 0028-0836 et 1476-4687, DOI 10.1038/s41586-026-10191-6).
Bibliographie
[modifier | modifier le code]- (en) Mitsuo Sakamoto et Yoshimi Benno, « Reclassification of Bacteroides distasonis, Bacteroides goldsteinii and Bacteroides merdae as Parabacteroides distasonis gen. nov., comb. nov., Parabacteroides goldsteinii comb. nov. and Parabacteroides merdae comb. nov. », International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, vol. 56, no 7, , p. 1599-1605 (DOI 10.1099/ijs.0.64192-0)
- (en) Arnold H. Eggerth et Bernard H. Gagnon, « The Bacteroides of Human Feces. », J Bacteriol, vol. 25, , p. 389-413 (DOI 10.1128/jb.25.4.389-413.1933)
- (en) Noel R. Krieg, « Family IV. Porphyromonadaceae fam. nov. », dans Krieg NR, Staley JT, Brown DR, Hedlund BP, Paster BJ, Ward NL, Ludwig W, Whitman WB (eds), Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, vol. 4, New York, Springer, , 2nd edn éd. (DOI 10.1007/978-0-387-68572-4), p. 61
- (en) KL Ormerod, DL Wood, N Lachner, SL Gellatly, JN Daly, JD Parsons, CG Dal'Molin, RW Palfreyman, LK Nielsen, MA Cooper, Mark Morrison, Philip M. Hansbro et Philip Hugenholtz, « Genomic characterization of the uncultured Bacteroidales family S24-7 inhabiting the guts of homeothermic animals », Microbiome, vol. 4, , p. 36 (DOI 10.1186/s40168-016-0181-2)
Liens externes
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- Ressources relatives au vivant :
